Es la máxima autoridad de dirección del Movimiento, constituida por todos sus afiliados.

La primera convención se desarrolló del 28 al 30 de agosto de 2014, con la participación de delegados de las organizaciones indígenas, que participaron en la construcción del proyecto político de MAIS: jóvenes, población afro, campesinos y ambientalistas. Las funciones de la Convención Nacional son:

1. Elegir los órganos de dirección, de salvaguarda y de control del movimiento MAIS.
2. Aprobar y reformar la agenda programática del MAIS, así como sus estatutos, plataforma ideológica, código ético y régimen disciplinario.
3. Fijar el valor de las contribuciones voluntarias, con supervisión de la Revisoría Fiscal y la Veeduría Garante.
4. Evaluar y aprobar los informes de gestión de la Dirección Nacional y el Comité Ejecutivo Nacional.
5. Pronunciarse con respecto a la coyuntura política y social del país.
6. Decidir sobre la disolución o anexión del MAIS a otros movimientos políticos.
7. Orientar las acciones, principios y rutas políticas e ideológicas a seguir por el MAIS.
8. Aprobar el Plan de Acción de la Dirección Nacional.
9. Delegar funciones a la Dirección Nacional y al Comité Ejecutivo Nacional.
10. Aprobar el sistema de auditoría interna del MAIS.
11. Definir el plan de trabajo regional.
12. Elegir a los candidatos del orden nacional, o definir los mecanismos para su elección.
13. Las demás que tengan origen en estos estatutos y en los documentos que hacen parte integral de los mismos.